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质粒双酶切的后目的片段怎么变大了
内切酶可能与DNA片段结合,造成条带凝胶迁移率改变。你可以在电泳前65℃加热10min,或者采用加有SDS的loading dye加样。这样可以消除迁移率变小的问题。
如果你的超螺旋那条特别亮,酶切后同样大小的DNA片段,由于超螺旋变为线性,电泳就会显示比超螺旋的带大。
首先从基因序列着手检查酶切位点是否正确;检查酶切实验,确认反应条件、缓冲溶液使用正确,不存在非特异性切割。前提是确定双酶切后载体骨架片段大小正确,条带亮度基本符合比例。分析载体与基因片段上的某处是否有共同酶切位点,再通过载体上的通用引物对重组质粒进行PCR验证。

提取质粒酶切后,双酶切和单酶切电泳条带一样,是怎么回事啊?
原因是相同的粘性末端形成消化,就像一个拼图,除了内容,双方充分满足。结合方式太多的可能性,如质粒和靶基因已正确连接,反转连接质粒和靶基因,质粒和质粒连接,连接目的基因和靶基因。 双酶切一般会有三个频段,正确的现象只应该有一个非常光明的。
双酶切电泳结果呈现一条带情况,通常意味着切割出的DNA片段大小差异显著。例如,当片段大小差距达到数千倍与数十倍,若实现了完全切割与充分电泳迁移,观察者将仅见到一条清晰的带。当切割的DNA片段大小差距不大,比如数千与几百倍,且切割与电泳过程充分,两段DNA片段都可清晰可见,形成两条带。
因此,单酶切和双酶切在电泳图上的表现不同主要是由于酶切位点和产生的黏性末端的不同。单酶切产生相同的黏性末端,导致更多的连接可能性,而双酶切由于两种酶的切割位点不同,产生的黏性末端各异,使得正确的连接方式更加明确。
应该出现的是一条带,即为线性质粒DNA 如果有2个酶切位点,且酶切位点相距较远,大于100bp以上,可以在凝胶电泳结果中显示2条带(小于100bp的话与质粒基因碱基数目相差太多,可能无法看清条带)通常做单酶切可以验证酶切位点及线性质粒大小等。通常酶切位点唯一,做双酶切实验验证重组质粒。
请问质粒双酶切时得到的目的条带较大是什么原因?
〖A〗、内切酶可能与DNA片段结合,造成条带凝胶迁移率改变。你可以在电泳前65℃加热10min,或者采用加有SDS的loading dye加样。这样可以消除迁移率变小的问题。
〖B〗、如果是单酶切,超螺旋质粒会变成开链DNA,开链的DNA在凝胶中泳动速度慢于超螺旋质粒,因此条带会偏大,这是酶切充分的情况。如果不充分,就会有大小有差距的几条带;如果是双酶切,而且片段大小适中,可以看见酶切的片段和载体,还有未切开的质粒。
〖C〗、线性化的跑得最慢。质粒酶切后,和没有酶切的对照相比。应该会多出一条带,这条带应该是跑得最慢的,也就是显得比原来的更大。
〖D〗、首先从基因序列着手检查酶切位点是否正确;检查酶切实验,确认反应条件、缓冲溶液使用正确,不存在非特异性切割。前提是确定双酶切后载体骨架片段大小正确,条带亮度基本符合比例。分析载体与基因片段上的某处是否有共同酶切位点,再通过载体上的通用引物对重组质粒进行PCR验证。
〖E〗、若酶切前已存在多条带,可能提示质粒样品中存在杂带(如杂菌污染或DNA降解)。半圆形条带的可能来源:半圆形条带通常与小片段DNA的泳动特性相关。在低浓度凝胶或长时间电泳条件下,小片段DNA可能因扩散作用呈现半圆形扩散痕迹,而非规则条带。
质粒电泳怎么看目的质粒的大小?
开环线性超螺旋。一般单酶切之后,此时的情况类似于开环结构,显示的是整个质粒的全长,此时对于maker去比对即可。双酶切位点情况 这类情况被双酶切之后,产物里面有两个片段分布,一个大片段,一个小片段,从琼脂糖凝胶电泳中看,前为小片段,后为大片段。
商品化的质粒我没有直接跑过电泳。我估计应该大部分是超螺旋构像。酶切后线性化条带电泳时所处的位置就指示质粒的大小。
明确观察要点:对于PCR跑胶的电泳图,主要看有无产物以及产物大小。在已知目标序列和引物的情况下,可先计算出产物大小,若计算值与PCR产物大小吻合,且条带清晰,该条带即为特异性产物。判断样本情况:每个胶孔添加的样本不同,可根据条带判断不同样本中是否有目标序列可被检出。
为什么质粒双酶切后显得更大了?
〖A〗、质粒酶切后质粒双切大小比单切大,和没有酶切的对照相比。应该会多出一条带,这条带应该是跑得最慢的,也就是显得比原来的更大。
〖B〗、首先从基因序列着手检查酶切位点是否正确质粒双切大小比单切大;检查酶切实验,确认反应条件、缓冲溶液使用正确,不存在非特异性切割。前提是确定双酶切后载体骨架片段大小正确,条带亮度基本符合比例。分析载体与基因片段上的某处是否有共同酶切位点,再通过载体上的通用引物对重组质粒进行PCR验证。
〖C〗、内切酶可能与DNA片段结合,造成条带凝胶迁移率改变。你可以在电泳前65℃加热10min,或者采用加有SDS的loading dye加样。这样可以消除迁移率变小的问题。
〖D〗、如果是单酶切,超螺旋质粒会变成开链DNA,开链的DNA在凝胶中泳动速度慢于超螺旋质粒,因此条带会偏大,这是酶切充分的情况。如果不充分,就会有大小有差距的几条带;如果是双酶切,而且片段大小适中,可以看见酶切的片段和载体,还有未切开的质粒。
〖E〗、双酶切:如果质粒被两种不同的限制性核酸内切酶切割,可能会形成两个不同大小的线性DNA片段。在电泳图谱上,这两个条带分别代表两个不同大小的线性DNA分子。如果切割后没有外源DNA片段连入,那么这两个条带的大小取决于切割位点的位置,可能与单一切割位点的线性DNA分子大小相近或不同。
〖F〗、在电泳凝胶上,切开后的质粒通常会显示出比未切开质粒更小的迁移距离,从而表现为更小的条带。如果进行单酶切,切开的质粒会形成两个大小相同的线形条带,但这两个条带的迁移距离都会比原始环状质粒小。如果进行双酶切并连入了外源片段,则会出现两条带,一条较小,一条较大。
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